《傷寒雜病論》是中國中醫學上的經典，是中醫臨床重要經典，被稱為是“醫方之祖”。同時《傷寒雜病論》奠定了“辨證論治”堅實的基礎。

中醫界共知，仲景著作為后世醫學奠立了堅實而廣泛的基礎。比如說《傷寒論》將“傷寒”病分為“六經”病予以辨證并分證治療。明代王肯堂《傷寒準繩》曾說：“仲景之法，凡云太陽病者，皆謂脈浮，頭項強痛、惡寒也;凡云陽明病者，皆謂胃家實也;凡云少陽病者，皆謂口苦、咽干、目眩也;凡謂太陰病者，皆謂腹滿、時痛，瀉利;凡曰少陰病者，皆謂脈微細，但欲寐也;凡云厥陰病者，皆謂氣上撞心，病吐蛔也。”這就指導讀者在六經辨證中如何抓住證脈重點，將不同的病程階段、病位、證候的傷寒六經病，予以分別施治。

在《金匱要略》中，仲景論述的病證很多，他在辨證方面，給后世以很大的啟示。如該書根據“狐惑”病不同的癥候，分別用湯藥及外治的熏法、洗法治療，并明確指出：“蝕于喉為惑，蝕于陰(陰指生殖器部)為狐。”在闡論“痙病”，癥狀以項背強急、口噤，四肢抽搐，甚則角弓反張為主)時，又根據證候特征的不同，分之為“剛痙”、“柔痙”二種。

痙病在“太陽病”中多見，仲景說，如果證兼“發熱無汗，反惡寒者”為“剛痙”;如果是“發熱汗出而不惡寒”，則稱之為“柔痙”，通過這樣的辨證以指導不同證型的治法。又如書中將瘧疾分為癉瘧、溫瘧、牡瘧、瘧母等不同的證型，并根據瘧疾不同的病名，各自列出針對性的方治。對于“虛勞”病，根據辨證患者的臨床表現，分別用小建中湯、八味腎氣丸、黃芪建中湯、薯蕷丸、酸棗湯及大黃 蟲丸等治療。

又如治療“痰飲”病，仲圣分之為懸飲(胸膜積液)、溢飲、支飲、伏飲、肺飲等，分別予以辨證處方。水腫(仲景稱之為“水氣”病)作為是常見多發病，《金匱》分之為風水、皮水、正水、里水、黃汗等，并據臨床上各種不同的證型，予以分別論治。再者，根據水腫病部位的差異，提示了后世醫家廣泛遵循的治則，即“諸有水者，腰以下腫，當利小便;腰以上腫，當發汗乃愈。”對于黃疸病，則分之為谷疸、女勞疸、酒疸、黑疸等，提示黃疸病因、病機、癥候的不同，在辨證中予以分別論治。而同樣是“便血”，仲景指出：“下血，先便后血，此遠血也，黃土湯主之。”“下血，先血后便，此近血也，赤小豆當歸散主之。”

以上只是將仲景突出辨證論治的思想予以舉例說明，后世臨床醫學(包括臨床各科)的辨證分型，均源自《傷寒雜病論》而有所變化與發展。我們過去所見《傷寒論》、《金匱要略》注家中，清代沈明宗分析傷寒辨證，以細致、全面著稱，他所撰《傷寒六經辨證治法》對清以后仲景學說研究者，具有很大的影響。