如果男性出現小陰莖的情況，不僅給男性的心理和精神方面帶來了非常大的壓力，更加重要的是導致夫妻性生活關系的不和諧以及不孕不育的產生，那么這種情況是非常嚴重的，引發它的病因應該進行詳細的了解才行。

1.促性腺激素分泌不足的性腺功能減退

(1)腦組織結構異常：無腦畸形患兒無下丘腦分泌功能即使腦垂體發育正常由于無促性腺激素釋放激素致使睪酮分泌少造成小陰莖先天性腦垂體不發育部分腦胼胝體發育不良導致的下丘腦功能障礙枕部腦膨出伴運動失調的小腦畸形等腦中線發育異常均因促性腺激素分泌不足而引起小陰莖此外還導致其他系統的多發畸形

(2)無腦組織異常的先天性促性腺激素釋放激素缺乏：此類原因引起的小陰莖比前者多見具體病因不清多為各種綜合征如Kallmann帕德維利綜合征(Prader-Willi)Lawrence-Moon-Beidel綜合征等常伴有多發畸形據研究與染色體基因異常有關還有因內分泌生化代謝異常導致的促性腺激素釋放激素黃體生成激素等缺乏癥

2.促性腺激素分泌過多的性腺功能減退

這類病人的下丘腦垂體分泌功能均正常只是在妊娠后期睪丸出現退行性變而致睪酮分泌減少通過負反饋途徑而致促性腺激素分泌過多引起小陰莖的原因主要在睪丸本身如先天性睪丸缺如睪丸下降不全等有的病人睪丸正常但其黃體生成激素受體異常以至不能分泌足量睪酮此外需注意有無性別異常

3.原發性小陰莖

除上述原因外還有少部分病人下丘腦-垂體-睪丸軸激素分泌正常但有小陰莖畸形到了青春期又多能增長病因不清楚推測有可能是胚胎后期促性腺激素刺激延遲一過性睪酮分泌下降等原因也有少部分患者可能為雄激素受體異常小陰莖病人可有性染色體異常如Klinefelter綜合征(47XXY)多X綜合征(48XXXY及49XXXXY)多染色體(69XXY三倍體)畸形

小陰莖的情況在社會當中的發病率還是非常高的，只是有的男性由于感覺到比較羞愧不愿意接受治療，從而產生了自欺欺人的做法和想法，所以為了能夠更早的消除隱患，需要及時的掌握病情的病因，從而能夠更好的進行控制。