隱睪病人在青春期后有很高的惡性病變發生率。隱睪發生惡性病變的發生率是正常人的25至48倍(Whiter及Welvar)大約10%的睪丸腫瘤發生于隱睪。由于隱睪的組織學異常，所以早期手術并不能防止隱睪發生惡性病變。而單側隱睪的病人，對側已降至陰囊正常位置的睪丸組織學亦有異常，所以亦有較高的惡性病變發生率。Johnson在單側隱睪惡性病變病的病人中發現有五分之一的惡性病變發生在非隱睪一側睪丸中，而雙側隱睪的病人，如果一側發生惡性病變另側睪丸有15%的機會也發生惡性病變。
隱睪的位置與惡性病變有明顯的關系。腹內隱睪惡性病變發生率四倍于腹股溝隱睪，而雙側腹內隱睪，如一側發生惡性病變另一側睪丸有30%的機會亦發生惡性病變。
在隱睪病人活檢中發現原位癌引起了對隱睪惡性病變的新認識其發生率在30%。
總之為了觀察隱睪的變化及早期發現惡性病變，應早期施行睪丸固定術，特別是腹內隱睪應早期移入陰囊，如不能移入陰囊中應做睪丸切除術。隱睪發生病惡性病變后，多為精原細胞瘤。應及時做睪丸根治性切除術及后腹膜區放射治療。