前列腺炎是很復雜的疾病，因此也導致了它在診斷和治療上會出現很多問題。前列腺炎為什么難以治愈呢?原因一般與下列因素有關：
一、前列腺排泄不通暢：前列腺有很多互相溝通的腺泡，這些腺泡又分成互相沒有交通的20-30條左右的導管，這些導管開口于后尿道、前列腺部，它是一個盲帶，排泄不容易通暢。
第二、前列腺的鄰近器官的影響：尿道從前列腺中央穿行而過，前列腺包繞于尿道周圍;左右成對的精囊，也是男性生殖系統的附屬腺，而起源于附睪的輸精管與精囊腺管匯合成為左右射精管后，穿入前列腺，共同開口于前列腺內的尿道上。慢性前列腺炎常與精囊炎、輸精管炎、附睪炎及后尿道炎等伴行存在，相互影響。
第三、腺體自身的結構的改變：體表發炎之后，會有紅腫熱痛，之后可能遺留下一個疤痕。前列腺發炎后的疤痕可以導致血管閉塞、腺體萎縮、纖維化，只是這個疤痕在體內，我們看不到。這種病理改變，一方面藥物進不去，另一方面里面的細菌清除不掉。
第四、前列腺的位置特點：前列腺是男性特有的生殖器官，深居于男性骨盆腔內，其形狀和大小很像板栗，底向上，尖向下，淡紅而稍帶灰色，包繞在男性尿道的起始部。
第五、全身其他因素的影響：一個康復的前列腺炎患者，他可能因為機體其他疾病，比如膀胱炎、輸尿管炎等，帶有病菌的尿液經常經過前列腺，就會導致前列腺反復發炎;或者是包皮過長，從尿道口反復發生逆行性感染而導致前列腺炎反復發作，不易治愈。