一般的藥物治療可以對過敏性鼻炎起到較好的治療效果，但對于嚴重的過敏性鼻炎，可以采用其它相關的治療方法。
明顯的鼻塞的癥狀可以使用激光，微波或者等離子射頻治療而達到滿意的效果，并通過減低鼻腔內神經的敏感性對打噴嚏和流清涕有一定的好處。最近用于臨床的低溫等離子系統已有報道對過敏性鼻炎尤其是重度過敏性鼻炎有明顯的效果，由于其對粘膜損傷小，無明顯副作用，其臨床意義已經開始被一些醫生所重視，可以做為治療過敏性鼻炎中替代激光和微波最佳選擇，但價格較貴是其缺點，國內較早開展等離子治療過敏性鼻炎（包括其它類型鼻炎）且有一定知名度的醫院有：上海第六人民醫院耳鼻喉科，南京八一醫院耳鼻喉科，北京京仁醫院耳鼻喉科，大連醫學院附屬醫院耳鼻喉科等。
脫敏療法，用已找出的變應原作脫敏劑，開始均采用小劑量作皮下注射，并逐漸增加劑量，到最大忍受量時改為維持量，直到癥狀消失為止。經此法治療的病人，體內可產生大量特異性IgG封閉抗體，可阻斷抗原與IgE抗體的結合，降低介質細胞的敏感性，從而起到治療作用，但由于過敏原可能很多，往往限制了其效果。
伴有鼻息肉的病人應該進行內窺鏡下鼻息肉的手術；為降低鼻腔內副交感神經的興奮性，可施行翼管神經切斷術或篩前神經阻斷術。