森田療法關于方法論和世界觀也有自己獨到的見解，方法論就是探討人生的哲學思想。通過對方法論和認識、實踐的規(guī)律的分解和剖析，能過從根源上對人有最直接的認識，能夠抓住根本性的東西，是最科學的方法。

1、無善惡陷入錯誤思想后，由此得出的善惡觀，完全是虛偽的，人為捏造的東西。善必須是真的。如果從自己純真的原本狀態(tài)出發(fā)，其中則無善惡。

2、睡夢中的有和無，有無相加等于無;迷惘的是與非，是非相加仍是非所謂迷惘，就是執(zhí)著于自己，不能正確地進行觀察思維。無論是注意或是其他活動，都必須是順應著當時的客觀情況，自自然然地流動前進。人們常常是從自己主觀愿望出發(fā)，想要如此這般地硬加安排一番。由于未能照想象的情況進行，所以，往往又形成思想上的沖突，反倒陷入了思想矛盾，倘能順從個人精神上的自然流動狀態(tài)狀態(tài)就會既無沖突，也沒有痛苦了。

3、欲擁一波消一波，千波萬波相繼起脫離自我的客觀事物誰也能看清。自我判斷的時候因為是面對自己本身，所以自己很難弄明白。因此依靠自我的了解是不能治病的。水面上的波浪再也不能用自己本身的水波來消除。

4、思想矛盾(惡智)所謂思想矛盾是指“應該如此”的理論與“就是如此”的事實之間有矛盾。據森田說我們的主觀與客觀、情感與知識、理解與體驗經常互相矛盾。這是理性認識上的方法錯誤，它總是錯誤地認為憑著合理的、合乎邏輯的理性能夠解決不合情理的情感方面的問題，并試圖解決這類問題。

5、切莫拘泥于理論切莫把自己的情況機械地與理論對照，勉強用它來校正自己那里好那里不好。最好切莫如此。但愿能順應自然，保持安心經時度日的情緒就很好。要逐漸領會某種體驗，在此基礎上才能形成正確的理論。如果把理論放在首位，就必然要陷入錯誤一味深入迷霧之中。

6、事實與實踐人生的問題不能靠理論或理想來解決，而要靠事實和實踐。人需要吃飯、希望工作，而且不愿墮落。人生的過程在于順從自然。這沒有定規(guī)的人生，要以事實為事實，要順其自然地服從它。

7、事實為真只有事實才是真實的。它是以情緒為準則相對應的詞。對無能為力的客觀事實，就要承認自己無能為力。

從理論上分析，將認識與實踐的規(guī)律進行分解，能夠取得科學性的同時，讓更多的人折服，相信推廣起來就能夠更加的順暢。這種將心理問題與哲學思想結合的方式說明任何事物都是相互聯(lián)系的。